Studerende, der har gennemført den 2-årige psykoterapeutiske grunduddannelse, kan fortsætte på den 2-årige overbygning, bestående af uddannelsens 3. og 4. år, der er tilrettelagt i et sammenhængende forløb på 28 obligatoriske undervisningsdage pr. år.
På den 2-årige overbygning er det primære fokus praktisk anvendt psykoterapi med henblik på at kvalificere sig yderligere i det arbejdsområde, man allerede nu arbejder indenfor - sekundært at skabe sig et arbejdsområde indenfor det psykoterapeutisk felt.
På 3. års overbygning påbegyndes en professionalisering af terapeutfunktionen, hvor det er obligatorisk at have egne klientforløb, samt supervision herpå.